根据现行土地增值税条例及细则规定，房地产企业在计算增值额时的扣除项目时主要包括以下五项 （一）取得土地使用权所支付的金额； （二）开发土地的成本、费用； （三）新建房及配套设施的成本、费用，或者旧房及建筑物的评估价格； （四）与转让房地产有关的税金； （五）财政部法规的其他扣除项目（比如加计扣除部分）。 贵公司发生的由于合同违约（如不能按时交房）支付给业主的违约金不属于计算土地增值税时可以扣除的项目。
