A、利用杂交技术培育出超级水稻原理是基因重组，A有关；B、通过返回式卫星搭载种子培育出太空椒，属于诱变育种，原理是基因突变，B无关；C、将苏云金杆菌的某些基因移植到棉花体内，培育出抗虫棉，属于基因工程育种，原理是基因重组，C有关；D、用高秆抗病和矮秆不抗病选育矮秆抗病的小麦，与基因重组有关，D有关．故选：B．
