犯了非法运输危险物质罪的处罚有：
1、非法运输毒害性、放射性、传染病病原体等危险物质的，处三年以上十年以下有期徒刑；
2、运输数量巨大或者造成严重后果的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。
如果是单位犯非法运输危险品罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照规定处罚。
法律依据
《中华人民共和国刑法》第一百二十五条 【非法制造、买卖、运输、邮寄、储存枪支、弹药、爆炸物罪】非法制造、买卖、运输、邮寄、储存枪支、弹药、爆炸物的，处三年以上十年以下有期徒刑;情节严重的，处十年以上有期徒刑、无期徒刑或者死刑。【非法制造、买卖、运输、储存危险物质罪】非法制造、买卖、运输、储存毒害性、放射性、传染病病原体等物质，危害公共安全的，依照前款的规定处罚。单位犯前两款罪的，对单位判处罚金，并对其直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依照第一款的规定处罚。
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