①等培养基冷却至50℃左右时，在酒精灯火焰附近倒平板，防止杂菌污染，①正确；
②不能将灭过菌的培养皿放在桌面上，因为桌面上可能有杂菌，②错误；
③右手拿锥形瓶，使瓶口迅速通过火焰，高温防止杂菌污染，③正确；
④倒平板时皿盖只需要倾斜出一定角度，在酒精灯火焰旁进行，④错误；
⑤右手将锥形瓶中培养基倒入培养皿，左手立即盖上皿盖，并通过酒精灯火焰，⑤正确；
⑥等待平板冷却5～10分钟，将平板倒过来放置，使皿盖在下，皿底在上，⑥错误．
故选：C．
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