增值税专用发票可以在增值税发票综合服务平台进行勾选认证抵扣，但是需要逐一勾选，专票较多的企业可以使用费耘系统进行批量勾选，跟增值税发票综合服务平台对接；收到的发票可以在系统中标记签收，可以设置勾选提醒，一键勾选，批量提交认证并且返回认证结果。
在电子税务局里面可以直接认证，认证之后就可以抵扣了。
增值税专用发票可以在当地的增值税发票后院确认平台上进行勾选确认。
插入税控盘，点击进入当地的增值税发票勾选确认平台上，点击勾选确认，输入发票号码，确认金额单位等信息是否正确，点击提交，最后把所有的应认证抵扣的发票都认证抵扣了，在进行统计，确认。
在增值税发票勾选平台里认证勾选确认抵扣，但要有相应的介质如税控盘或税务UK等
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