A、孟德尔发现遗传定律的方法是假说--演绎法，A正确；B、摩尔根证明基因在染色体上的方法是假说--演绎法，B错误；C、萨顿提出基因在染色体上的方法是类比推理，C错误；D、赫尔斯和蔡斯证明DNA是遗传物质采用同位素标记法，D错误．故选：A．
