尼奥
基努·李维斯饰
上集尼奥终于意识到自己的能力和使命，中弹“复活”的同时，他变成了无所不能“救世主”。结尾的“飞升”象征着人类超级英雄的诞生，本片中尼奥将带领锡安基地的人民，打响对机器世界的反击战， 崔妮蒂
凯瑞-安·莫斯饰
尼奥爱人，一名逃离了矩阵的电脑程序员和黑客，因侵入一个极其安全的数据库而在黑客界闻名。是墨菲斯的助手，帮助其他人逃离矩阵。 墨菲斯
劳伦斯·菲什伯恩饰
Nebuchadnezzar号飞船上的船长。他和他的船员的使命是保护人类最后的城市锡安，并将其他人从矩阵中解救出来。一直在寻找尼奥，并坚信尼奥就是救世主。他在锡安很受欢迎，但在矩阵的特工眼里是一名被通缉的恐怖分子。 特工史密斯
雨果·维文饰
矩阵中的杀毒程序，他在矩阵中是没有身体的，由于是杀毒程序，所以被矩阵赋予了超越常人的能力。在矩阵中他具有改写人类角色程序的能力，所以可以不断借用他人身体。是尼奥最大的对手。
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