不需要，因为该事项不是增值税应税行为。
具体：
《中华人民共和国增值税暂行条例》第一条， 在中华人民共和国境内销售货物或者加工、修理修配劳务（以下简称劳务），销售服务、无形资产、不动产以及进口货物的单位和个人，为增值税的纳税人，应当依照本条例缴纳增值税。
问题中的事项属于将机构整体转移给政府，不适用上述任何一个定义。同时，这项行为也不是“销售”，是配合政府回收的指令而收到的补偿。销售是买卖双方均有选择的余地，政府回收该机构，你可以拒绝吗？
辅助参考政策：国税总局公告2013年66号，以及财税（2016）36号文附件2第一条第（二）项第5点，明确：“纳税人在资产重组过程中，通过合并、分立、出售、置换等方式，将全部或者部分实物资产以及与其相关联的债权、负债经多次转让后，最终的受让方与劳动力接收方为同一单位和个人的，其中涉及的不动产、土地使用权和货物的转让行为均不征收增值税”
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