户籍转移时新农村合作医疗并不会一并转移。户籍转移手续由公安机关操作、处理,只是针对当时人户籍关系的转移;新农村合作医疗是在当地社保机构的参保,公安机关的户籍管理并不直接掌握这一信息,且不属于其业务范围。因此新农村合作医疗并不会随同当事人户籍关系的转移而转移,需要时当事人应到当地社保机构办理转移手续。
与你户口迁出无关,仍然可以使用。