北魏贾思勰著的《齐民要术》一书，是完整地保存下来的一部杰出的古代农业科学著作｡在微生物学方面，这部书也有丰富的内容，它记录了我国当时农业和农村手工业中应用微生物知识的许多重要史实，有些还上升为比较系统的规律性认识｡
在微生物学发展史上，《齐民要术》是一部重要经典｡例如，在书中提出，曲成熟的标准，应该是曲中长满了各种菌，所谓“五色衣成”;把醋酸的形成和醋酸菌形成的膜联系起来，并且意识到了“衣”是有生命的物质｡
贾思勰用“鱼眼汤沸”这样生动的语言，描述了酒精发酵的时候二氧化碳释放的现象｡
还应当指出，书中把制酱用的以麦粒制成的曲､面粉制成的曲和发芽的谷物放在一起列作为一章来论述，表明当时已经意识到这三者之间的内在联系｡
现在看来，这些都是和水解蛋白质､淀粉的水解酶类有关的｡可以说，作者已经有了类似今天“酶制剂”的朦胧意识｡
至宋代，已经知道制曲的时候把优良的老曲涂在培养前的生曲表面，即所谓“传酷”的方法｡这类似于今天的接种操作，曲的质量就更加容易保证了｡
正是通过千百年来的选育，我国的曲有许多生产能力极强的菌种｡例如小曲中的根霉，它的糖化力之强是罕见的｡
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