有效。只要对方不是针对你，还能拿出别的有利证据，你这没有任何问题，不用担心。
购房合同是当时买房时的有力证据，而且你在购房前，没有去公证吗？一般来说是有效的。就怕对方又反悔来个大逆转，那就麻烦了。
本身国家的态度就是购买小产权房不受法律保护的，你合同丢了最好去找开发商复印一份留着，不让万一有什么意外情况发生，对你很不利的
