南京现在办健康证肯定是是都免费的;但只是在南京市或所属的市(区)县级卫生局(防疫站)办理才免费。。。因为从今年4月1日起,在国内大部分省市(区)县办理健康证就免费了。但是每天都是很多人,甚至排号,限名额。