第一，最直接的，就是雌雄异花。雌花上没有雄蕊，雄花上没有雌蕊，从根本上就没有自花授粉的可能。第二，雌蕊雄蕊不同时成熟。比如一串红等植物是雄蕊先成熟，雌蕊后成熟；而车前草等则反之，雌蕊先，雄蕊后。第三，就是在基因层面上，自花不育。通过调控某些基因的表达，一些植物可以做到同一花上授粉时，不能形成受精卵，只有另一植株上的花才行。这也有效的避免的自花授粉。此外还有一些植物在花上有一些特殊结构，也可以防止自花授粉。
