中科院是部级,而研究所是厅级。
1.中国科学院（Chinese Academy of Sciences），中国国家最高学术机构，成立于1949年11月，是中国自然科学与高新技术的综合研究与发展中心。
中国科学院有6个学部（数学物理学部、化学部、生命科学和医学学部、地学部、信息技术科学部、技术科学部），12个分院（沈阳、长春、上海、南京、武汉、广州、成都、昆明、西安、兰州、新疆、重庆）、104家直属研究机构、4个国家实验室、85个国家重点实验室、153个中国科学院重点实验室、19个国家工程技术研究中心、10个国家工程实验室以及212个野外观测台站，3所高等学校、4个文献情报中心、3个技术支撑机构和2个新闻出版单位，全院科研人员达5万余人，分布在全国20多个省（市）。
1949年3月下旬中共中央进驻北平，开始酝酿中国科学院，由郭沫若负责。历经变革，在1954年9月21日全国人大第一次会议通过《中华人民共和国国务院组织法》，不再把科学院列为政府部门。
2.虽然是事业单位，但从级别来看，其待遇上，院长属于部长级别，而研究所长则相当于正厅的级别。
所长一般为单位派驻地方的机构领导，如：派出所所长，税务所所长，储蓄所所长等。是行政单位在地方最低一级机构的总负责人。
行政单位和事业单位：
（1）内涵不同——行政单位是国家机关，而事业单位是实施政府某项公益服务的部门，是社会服务组织。
（2）担负的职责不同——行政单位是负责对国家各项行政事务进行组织、管理和指挥；而事业单位是为了社会的公益目的从事教育、文化、卫生、科技等活动。
（3）编制和工资待遇的来源不同——行政单位使用行政编制、由国家行政经费负担。事业单位使用事业编制，由国家事业经费负担。事业单位有全额拨款的，有部分拨款的，还有事业单位企业化管理的。行政单位人员的工资按《公务员法》由国家负担，而事业单位则根据不同的管理模式实行不同的待遇。 行政单位或事业单位根据工作性质，也有具有行政事业编制的非公务员的人就职，一般是从事后勤保障的工勤人员，他们的待遇除职权不同外，收入和公务员完全一致。
基层乡镇的司法所副所长什么行政级别
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