A、我国是世界上生物多样性最丰富的国家之一．A正确；B、生物的多样性包括基因的多样性、生物种类的多样性、生态系统的多样性，B正确；C、生态系统的多样性的实质是基因的多样性，C错误；D、威胁生物生存的原因有栖息地被破坏、偷猎、外来物种入侵、环境污染、其他原因等．其中最主要的原因就是栖息地等生态环境的破坏以及偷猎．保护生物的栖息环境，保护生态系统是保护生物多样的根本措施．D正确．故选：C
